Proteomics

Proteomics je rozsáhlé studium bílkoviny, zvláště jejich struktury a funguje. Tento termín byl vytvořen tvořit analogii s genomics, a je často viděn jak " další krok ", ale proteomics je hodně komplikovanější než genomics. Nejvíce důležitě, zatímco genom je poněkud konstantní entita, proteome stále se mění přes jeho biochemical vzájemná ovlivňování s genomem. Jeden organismus bude mít radikálně odlišný výraz bílkoviny v různých částech jeho těla a v různých fázích jeho životního cyklu.

Celistvost bílkovin v existenci v organismu skrz jeho životní cyklus, nebo na menším měřítku celistvost bílkovin nalezených ve zvláštním buněčném type pod konkrétním druhem stimulace, být odkazoval se na jak Proteome organismu nebo typ buňky příslušně.

S dokončením hrubého návrhu člověk genom, mnoho výzkumníků je nyní dívat se na jak geny a bílkoviny se ovlivňují tvořit jiné bílkoviny. Překvapivý poznatek Člověk projekt genomu je to tam být daleko méně genů ten kód bílkovin v lidském genomu než v člověku jsou bílkoviny proteome (~ 33, 000 genů vs ~ 200, 000 bílkovin). Tento nález se rozbije brzy " jeden gen = jedna bílkovina " hypotéza a představuje náročný problém pro vědce: To zkatalogizuje všechny lidské bílkoviny a zjistí jejich funkce a vzájemná ovlivňování. Někteří říkali toto " člověk Proteome projekt ", ale žádný oficiální titul má zatím been adoptoval.

Klíčové technologie použitý v proteomics výzkum zahrnovat masový spectrometry, rentgenovat crystallography, NMR a krystalizovat electrophoresis.

Dva hlavní přístupy k proteomics existovat: studium v-vivo vzorky a syntéza recombinant bílkoviny. Ve druhém příkladě, techniky genového inženýrství jsou zvyklé na klon DNA šablona pro bílkovinu být syntetizován a spojit tyto gen do buňek hostitele, typicky baktérie, který být předstíral, že vyjádří bílkovinu ve velkém měřítku.

Bílkovina pak musí být extrahován z buňek hostitele a čištěný. Následně, čistá bílkovina je předložena pro krystalizaci (a pak rentgenovat) nebo NMR pro strukturální rozhodnutí. NMR je ne efektivní pro velké bílkoviny.

Proteomics je větší výzva než genomics protože 3-rozměrná geometrie bílkovin je kritická v jejich funkci. To je důležité a náročné k hájemství tato geometrie přes všechny kroky popisovala nahoře.

Viz též: glycomics